U oblasti zaštite živote sredine od zagađenja koju mogu da prouzrokuju industrijska postrojenja, Energoprojekt Industrija je specijalizovala tim stručnjaka. Oni se bave opštim problemima ekologije, kao i specifičnim aspektima primene određene tehnologije na tretmanu otpada nastalog iz industrijskih i neindustrijskih izvora, u cilju rešavanja njihovog adekvatnog odlaganja.

Aerozagadjenja
Kroz tehničko rešenje tretirani i rešeni problemi aerozagadjenja za TO "Novi Beograd", Beograd; TO "M. Blagojević" Lučani; TO "Prvi Partizan" Učice; TO Šećerane u Šapcu i Požarevcu; TE TO "Borovo" Borovo; KO"Dunav" i KO"Voždovac" u Beograd i dr.

Otpadni gasovi
Kroz tehničko rešenje tretirani i rešeni problemi otpadnih gasova: Gasifikacija "Kosovo" Obilić; "Milan Blagojević" Lučani: Fabrika tapeta "Hlorvinil" Kaluš; Elaktroliza Bor; "Natron" Maglaj; Elektronska industrija Niš i dr.

Hemijske supstance
Kroz tehničko rešenje tretirani i rešeni problemi štetnog dejstva hemijskih supstanci u pogonima farmaceutske industrije: Fabrike lekova "Zorka Pharma" Šabac; Nove fabrike "ICN Yugoslavija, Galenika"; Fabrika galenske proizvodnje "Hemofarm" Vršac; Fabrika lekova Tjumen; Rekonstrukcija fabrike lekova Zorka Pharma Šabac; Pogon galenskih formi "Fampharm" Beograd; Novi pogon lekova enteralna proizvodnja i galenska "Jugoremedija" Zrenjanin; Pogon za hidrodestilaciju i višenamensku sintezu "Zdravlje" Leskovac; Pogon antibiotika "Hemofarm" u Dubovcu.

Otprašivanja
Projekti otprašivanja u termoelektranama; drvopreradjivačkim i farmaceutskim pogonima: TE "Bitola", TE "Pljevlja"; TE "Kostolac"; TE "Drmno", TE "Morava"; Drvni kombinati u Novokuznjecku i Norilsku u Rusiji; "Špik" u Ivanjici i "Česma" u Bjelovaru; Industrija papira "M. Blagojević" Lučani; Fabrike lekova "Jugoremedija", "Hemofarm", "ICN Yugoslavija Galenika".

Zaštita od buke
Projekti zaštite od buke u objektu Kompresorska stanica "Zorka" Šabac, Hotel "Kroacija" Cavtat; Pozorište "Boško Buha" Beograd i dr.

Radioaktivnost
Sprečavanje štetnog dejstva radionukleida: "Tehnički institut" Žarkovo; Banka biljnih gena Beograd i dr.

Zaštita vodotokova
Projekti zaštite vodotokova od otpadnih industrijskih voda za projektovane klanice, hladnjače sa preradom, punionice mineralnih voda, kožare, mlekare i druge objekte prehrambene, hemijske i farmaceutske industrije.

Odlaganje i tretman otpadaka
Kroz tehnička rešenja industrijskih objekata tretirani su industrijski otpaci različitih industrijskih grana: Prehranbena, Hemijska, Famraceutska, Metalna, Matalopreradjivačka, Drvna, Celuloze, Papira, Tekstila, Gradjevinskih materijala i dr.; Transport rude: Kavadarci; Transport i odlaganje jalovine: Bor, Majdanpek; odlaganje i tretman gradskih otpadaka: studija i projekat za Beograd.